Auf der Mossy Bottom Farm steigt die Vorfreude auf Halloween. Doch ausgerechnet kurz vor dem grossen Fest zerstört der tollpatschige Farmer den liebevoll angelegten Kürbisgarten der Schafherde. Für Shaun das Schaf ist klar: Halloween muss gerettet werden. Entschlossen, das Problem zu lösen, wagt er ein ungewöhnliches wissenschaftliches Experiment. Doch schon bald geraten die Dinge ausser Kontrolle. Als der Farmer plötzlich spurlos verschwindet und ein mysteriöses, haariges Ungeheuer die Wälder von Mossingham unsicher macht, ist das Chaos perfekt. Auf Shaun und seine wolligen Freunde wartet ein ebenso turbulentes wie urkomisches Abenteuer voller Spannung, Humor und typisch britischem Charme.